Le règlement intérieur définit les principes et règles du fonctionnement général de l’École Française de Bujumbura, Nelson Mandela.  Il fait référence aux textes et instructions réglementaires de l'Agence pour l'Enseignement Français à l'Étranger (AEFE) et de l'Éducation Nationale Française, adaptés aux spécificités de l'établissement dans son contexte national et international. 

L'inscription dans l'établissement est conditionnée par une signature, figurant dans le Règlement Intérieur, attestant la prise de connaissance de ce règlement et son acceptation en tous ses termes, y compris les termes relatifs aux modalités de paiement des droits de scolarité, qui en font partie intégrante.